Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC9O14530 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC9O14530 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC9O14530 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms