Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIP1O00291 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HIP1O00291 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIP1O00291 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIP1O00291 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HIP1O00291 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIP1O00291 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIP1O00291 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIP1O00291 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HIP1O00291 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIP1O00291 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIP1O00291 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HIP1O00291 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIP1O00291 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIP1O00291 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HIP1O00291 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
HIP1O00291 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIP1O00291 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIP1O00291 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIP1O00291 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIP1O00291 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIP1O00291 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIP1O00291 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HIP1O00291 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HIP1O00291 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HIP1O00291 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HIP1O00291 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HIP1O00291 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIP1O00291 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIP1O00291 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HIP1O00291 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIP1O00291 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIP1O00291 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIP1O00291 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIP1O00291 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIP1O00291 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HIP1O00291 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIP1O00291 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIP1O00291 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIP1O00291 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIP1O00291 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIP1O00291 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIP1O00291 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIP1O00291 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIP1O00291 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HIP1O00291 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIP1O00291 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIP1O00291 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIP1O00291 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIP1O00291 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIP1O00291 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIP1O00291 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
HIP1O00291 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HIP1O00291 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIP1O00291 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIP1O00291 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIP1O00291 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIP1O00291 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIP1O00291 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIP1O00291 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIP1O00291 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIP1O00291 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIP1O00291 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIP1O00291 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIP1O00291 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIP1O00291 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HIP1O00291 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIP1O00291 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIP1O00291 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIP1O00291 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIP1O00291 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIP1O00291 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIP1O00291 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIP1O00291 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIP1O00291 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIP1O00291 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIP1O00291 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HIP1O00291 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIP1O00291 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIP1O00291 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIP1O00291 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIP1O00291 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIP1O00291 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIP1O00291 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIP1O00291 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIP1O00291 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIP1O00291 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIP1O00291 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIP1O00291 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HIP1O00291 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HIP1O00291 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIP1O00291 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIP1O00291 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIP1O00291 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIP1O00291 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIP1O00291 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIP1O00291 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIP1O00291 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HIP1O00291 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HIP1O00291 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms