Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3QW42 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3QW42 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3QW42 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3QW42 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3QW42 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
J3QW42 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3QW42 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3QW42 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3QW42 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3QW42 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3QW42 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3QW42 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3QW42 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3QW42 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
J3QW42 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
J3QW42 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
J3QW42 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
J3QW42 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
J3QW42 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
J3QW42 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
J3QW42 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
J3QW42 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
J3QW42 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
J3QW42 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
J3QW42 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
J3QW42 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
J3QW42 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QW42 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QW42 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QW42 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QW42 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QW42 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
J3QW42 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
J3QW42 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
J3QW42 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
J3QW42 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
J3QW42 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
J3QW42 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
J3QW42 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
J3QW42 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
J3QW42 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
J3QW42 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
J3QW42 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
J3QW42 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
J3QW42 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QW42 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QW42 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
J3QW42 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QW42 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QW42 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QW42 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QW42 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QW42 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QW42 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QW42 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QW42 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QW42 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QW42 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QW42 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QW42 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QW42 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QW42 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QW42 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QW42 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QW42 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QW42 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QW42 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QW42 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QW42 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QW42 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QW42 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QW42 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QW42 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QW42 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QW42 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QW42 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QW42 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QW42 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QW42 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QW42 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QW42 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QW42 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QW42 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QW42 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QW42 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QW42 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QW42 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QW42 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QW42 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QW42 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QW42 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QW42 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QW42 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QW42 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QW42 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QW42 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QW42 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QW42 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QW42 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms