Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms