Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms