Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRM5B3KS81 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM5B3KS81 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM5B3KS81 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms