Protein–RNA interactions for Protein: A8MV72

Putative UPF0607 protein ENSP00000382826, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MV72 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A8MV72 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A8MV72 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A8MV72 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A8MV72 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A8MV72 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A8MV72 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A8MV72 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A8MV72 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A8MV72 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A8MV72 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
A8MV72 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A8MV72 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A8MV72 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A8MV72 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A8MV72 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A8MV72 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A8MV72 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A8MV72 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MV72 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MV72 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A8MV72 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MV72 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A8MV72 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MV72 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MV72 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A8MV72 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MV72 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
A8MV72 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MV72 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MV72 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A8MV72 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A8MV72 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A8MV72 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A8MV72 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A8MV72 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
A8MV72 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A8MV72 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MV72 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MV72 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MV72 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A8MV72 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MV72 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MV72 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MV72 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A8MV72 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A8MV72 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MV72 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MV72 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MV72 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
A8MV72 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MV72 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MV72 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MV72 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MV72 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MV72 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MV72 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MV72 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MV72 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MV72 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MV72 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MV72 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MV72 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MV72 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MV72 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MV72 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MV72 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MV72 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MV72 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MV72 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MV72 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MV72 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MV72 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MV72 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MV72 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MV72 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MV72 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MV72 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MV72 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MV72 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MV72 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MV72 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MV72 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MV72 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MV72 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MV72 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MV72 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MV72 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MV72 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MV72 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A8MV72 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MV72 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MV72 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MV72 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MV72 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MV72 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MV72 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MV72 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A8MV72 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A8MV72 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms