Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM90A7PA6NKC0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM90A7PA6NKC0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM90A7PA6NKC0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM90A7PA6NKC0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM90A7PA6NKC0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM90A7PA6NKC0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM90A7PA6NKC0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM90A7PA6NKC0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM90A7PA6NKC0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM90A7PA6NKC0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM90A7PA6NKC0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM90A7PA6NKC0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM90A7PA6NKC0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms