Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE2

SMCO2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO2A6NFE2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMCO2A6NFE2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMCO2A6NFE2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMCO2A6NFE2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms