Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms