Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL4Q9C0H6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms