Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF407Q9C0G0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms