Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM55Q9BYV6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms