Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YTHDF1Q9BYJ9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms