Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms