Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms