Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPALINQ96PE5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms