Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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CLIP4Q8N3C7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CLIP4Q8N3C7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLIP4Q8N3C7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CLIP4Q8N3C7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CLIP4Q8N3C7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CLIP4Q8N3C7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP4Q8N3C7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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