Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDKL3Q8IVW4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms