Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTF1Q16619 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTF1Q16619 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTF1Q16619 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTF1Q16619 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTF1Q16619 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTF1Q16619 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms