Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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SGCAQ16586 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SGCAQ16586 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGCAQ16586 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGCAQ16586 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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