Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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