Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NTRK3Q16288 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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