Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NECTIN1Q15223 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NECTIN1Q15223 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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