Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms