Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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RAB40BQ12829 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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RAB40BQ12829 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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RAB40BQ12829 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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RAB40BQ12829 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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RAB40BQ12829 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB40BQ12829 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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