Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC173Q0VFZ6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms