Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EP300Q09472 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EP300Q09472 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EP300Q09472 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EP300Q09472 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EP300Q09472 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EP300Q09472 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EP300Q09472 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EP300Q09472 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EP300Q09472 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms