Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms