Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CAV1Q03135 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAV1Q03135 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms