Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAE1P78406 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAE1P78406 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAE1P78406 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAE1P78406 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAE1P78406 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAE1P78406 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAE1P78406 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAE1P78406 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms