Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CRIP1P50238 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CRIP1P50238 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms