Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTDSS1P48651 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTDSS1P48651 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms