Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB5P28074 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB5P28074 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms