Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB9P17482 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms