Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACADSP16219 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms