Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME1P15531 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME1P15531 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NME1P15531 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NME1P15531 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NME1P15531 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NME1P15531 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms