Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC43A1O75387 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC43A1O75387 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC43A1O75387 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC43A1O75387 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC43A1O75387 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC43A1O75387 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC43A1O75387 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC43A1O75387 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC43A1O75387 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC43A1O75387 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms