Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKNO60260 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKNO60260 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKNO60260 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKNO60260 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKNO60260 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKNO60260 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKNO60260 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKNO60260 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKNO60260 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKNO60260 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKNO60260 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKNO60260 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKNO60260 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKNO60260 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKNO60260 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKNO60260 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKNO60260 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKNO60260 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKNO60260 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKNO60260 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKNO60260 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKNO60260 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKNO60260 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKNO60260 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKNO60260 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKNO60260 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKNO60260 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms