Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.471e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 PHRF1-206ENST00000534320 5178 ntTSL 517.58■□□□□ 0.41e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.331e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 MCF2L-229ENST00000488765 3205 ntTSL 216.94■□□□□ 0.31e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.252e-9■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.181e-6■■□□□ 11.8
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PRPF4O43172 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.431e-6■■□□□ 11.8
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PRPF4O43172 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.769e-7■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 MAZ-204ENST00000561855 672 ntTSL 514.84□□□□□ -0.039e-7■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 POLR3E-218ENST00000569787 727 ntTSL 312.99□□□□□ -0.338e-7■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.054e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 DAZAP1-208ENST00000589874 3642 nt14.19□□□□□ -0.141e-7■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 DAZAP1-203ENST00000585485 3943 ntTSL 213.18□□□□□ -0.31e-7■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.368e-11■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.748e-11■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 CYBA-203ENST00000562209 624 ntTSL 518.38■□□□□ 0.531e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.241e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 CYBA-204ENST00000563526 1052 ntTSL 214.75□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 CYBA-209ENST00000568278 439 ntTSL 512.45□□□□□ -0.421e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 511.7□□□□□ -0.547e-8■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 SPATS2-218ENST00000551540 720 ntTSL 521.77■■□□□ 1.084e-7■■□□□ 11.8
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PRPF4O43172 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.923e-11■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.893e-11■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 SPATS2-205ENST00000548388 564 ntTSL 216.46■□□□□ 0.234e-7■■□□□ 11.8
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PRPF4O43172 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.054e-7■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-11■■□□□ 11.8
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