Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NOTOA8MTQ0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms