Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYTH4Q9UIA0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH4Q9UIA0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms