Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL11Q9NVR0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms