Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms