Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms