Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms