Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BEST4Q8NFU0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BEST4Q8NFU0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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