Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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