Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
METAP1DQ6UB28 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
METAP1DQ6UB28 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms