Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms